@Garry050 GSIビルドに使っているスクリプトのfork元に大きな変更が入ったので、
github.com/FlokoROM-GSI/treble
を参考にlineage_patches_unifiedのcloneをしてください。
ビルド時のコマンドにも変更が入っています。

treble_build_floko/README.md at 11.0-unified · FlokoROM-GSI/treble_build_floko

@Garry050 進捗ダメです…。GMSのエラーについてはMIUIでも発生していたのを新たに確認したのでFeliCaが動かない原因ではなさそうで、原因追求が難航しています。

@Garry050 deodexした後MIUI特有のコードを削除して、Magiskで元のNfcNciを削除&NqNfcNciに差し替えしていました。
別件で探していて見つけたのですが、もしかするとこのモジュールを入れてしまえばsmaliを弄ることなく動くかもしれません。
github.com/reiryuki/MIUI-Core-

GitHub - reiryuki/Miui-Core-Magisk-Module

@Garry050 ダメでしたか…。