と思ったらどこかに行ってしまった
ただ、PulseAudioの自動起動エントリ見えてたら、 X-GNOME-HiddenUnderSystemd=true なんてキーがあって、XDG Autostart以外にも起動方法があるのかしらと思うなど
該当する自動起動エントリの.desktopファイルが分かれば、同名のファイルを~/.config/autostart以下に作成して、 Hidden=true って記載を追加すれば自動起動止められる
@zundan 自動起動エントリを隠す仕様があるようですね
Ubuntuの記載かつ古いので該当するか分からないですが……
https://help.ubuntu.com/community/ShowHiddenStartupApplications